| Probe | Size | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Markers | Comments | |||
| yUP8B8 | 180 | mi193 (98.91) | yUP9E12L | >1 location | |||||||||||||||
| yUP8E8 | 300 | mi116 (40.02) | mi193 (98.91) | >1 location | |||||||||||||||
| yUP12E12 | 240 | mi116 (40.02) | mi193 (98.91) | >1 location | |||||||||||||||
| yUP24A8 | 260 | mi116 (40.02) | mi193 (98.91) | >1 location | |||||||||||||||
| CIC3E7 | - | mi116 (40.02) | mi193 (98.91) | >1 location | |||||||||||||||
| CIC3E6 | 420 | mi116 (40.02) | mi193 (98.91) | >1 location | |||||||||||||||
| CIC11A7 | 670 | mi193 (98.91) | |||||||||||||||||
| yUP6E8 | 310 | mi193 (98.91) | |||||||||||||||||
| yUP8E5 | 200 | mi193 (98.91) | |||||||||||||||||
| yUP19G7 | 250 | mi193 (98.91) | |||||||||||||||||
| yUP4H11 | 270 | mi193 (98.91) | |||||||||||||||||
| yUP4A10 | 260 | g4121(AC) | |||||||||||||||||
| yUP13D8 | 200 | g4121(AC) | |||||||||||||||||
| yUP13F1 | 240 | g4121(AC) | |||||||||||||||||
| yUP18B8 | 20 | g4121(AC) | |||||||||||||||||
| yUP19C2 | 345 | g4121(AC) | |||||||||||||||||
| EG20E7 | - | g4121(AC) | |||||||||||||||||
| EG20H9 | - | g4121(AC) | |||||||||||||||||
| EG21A9 | - | g4121(AC) | |||||||||||||||||
| yUP14D9 | 170 | g4121* | *=Unconfirmed or weak | ||||||||||||||||
| yUP14G12 | 420 | g4121* | *=Unconfirmed or weak | ||||||||||||||||
| yUP15A9 | 330/280 | g4121* | *=Unconfirmed or weak | ||||||||||||||||
| yUP20F9 | 100 | g4121* | *=Unconfirmed or weak | ||||||||||||||||
| yUP22F11 | 190 | g4121* | *=Unconfirmed or weak | ||||||||||||||||
| CIC10E10 | 450 | g17517 | g4121(AC) | K2 | |||||||||||||||
| CIC6D1 | 450 | g17517 | |||||||||||||||||
| yUP17C10 | 100 | mi185 (98.87) | |||||||||||||||||
| yUP19E4 | 290 | mi185 (98.87) | |||||||||||||||||
| yUP24E3 | 280 | mi185 (98.87) | |||||||||||||||||
| CIC6E3 | 550 | CDs8 (98.83) | mi185 (98.87) | pCITd117* (100.44) | *From BAC data | ||||||||||||||
| CIC9H12 | 620 | CDs8 (98.83) | g4552 (100.94) | mi185 (98.87) | pCITd117* (100.44) | *From BAC data | |||||||||||||
| CIC7D8 | 470 | CDs8 (98.83) | g4552 (100.94) | "182" | mi185 (98.87) | ||||||||||||||
| CIC10G7 | 550 | "182" | SR3 | ||||||||||||||||
| EG7F8 | - | DEF116 | Meyerowitz | ||||||||||||||||
| ABI9A1 | 180 | DEF116 | Meyerowitz | ||||||||||||||||
| yUP2F3 | 350 | yUP19H6L | |||||||||||||||||
| yUP2D12 | 350 | yUP19H6L | g4552 (100.94) | g16595 | yUP6D3R* | *=Unconfirmed or weak | >1 location | ||||||||||||
| yUP1H4 | 350 | g4552 (100.94) | g16595 | pCITd117* (100.44) | *From BAC data | ||||||||||||||
| yUP7E6 | 250 | g4552 (100.94) | |||||||||||||||||
| yUP8H3 | 275 | g4552 (100.94) | |||||||||||||||||
| yUP11F3 | 320 | yUP19H6L | g4552 (100.94) | ||||||||||||||||
| EG12F4 | - | g4552 (100.94) | ABI9A1LE | EW2B8L | |||||||||||||||
| EG13H3 | - | g4552 (100.94) | |||||||||||||||||
| EG9G2 | 200 | ABI9A1LE | EW17B3LE | EW2B8L | Meyerowitz | ||||||||||||||
| EG6H11 | - | g4552 (100.94) | ABI9A1LE | EW17B3LE | EW2B8L | ||||||||||||||
| EW17B3 | 140 | g4552 (100.94) | ABI9A1LE | EW17B3LE | EW2B8L | Meyerowitz | |||||||||||||
| EW2B8 | 120 | g4552 (100.94) | ABI9A1LE | EW2B8L | Meyerowitz | ||||||||||||||
| EG17F1 | 170 | EG17F1LE | EW17B3LE | EG8C8L | |||||||||||||||
| EG8C8 | 110 | EG17F1LE | EG8C8L | ||||||||||||||||
| EG3B1 | 160 | EG17F1LE | ABI13A11L | ||||||||||||||||
| ABI14G4-1 | 210 | EG17F1LE | ABI14G4-1LE | EG8C8L | ABI13A11L | EG23G10L | EW19A2L | yUP1D11L | |||||||||||
| ABI13A11 | 135 | EG17F1LE | EG8C8L | ABI13A11L | |||||||||||||||
| ABI15D7 | 150 | ABI14G4-1LE | ABI15D7L | EG23G10L | yUP1D11L | ||||||||||||||
| EG23G10 | 160 | ABI14G4-1LE | yUP1G3L | ABI15D7L | EG23G10L | yUP1D11L | |||||||||||||
| EW19A2 | - | ABI14G4-1LE | ABI15D7L | EG23G10L | EW19A2L | yUP1D11L | |||||||||||||
| yUP1D11 | 360 | pKY65 | ABI14G4-1LE | AP1 | yUP1G3L | EG23G10L | |||||||||||||
| yUP1G3 | 160 | pKY65 | AP1 | yUP1G3L | |||||||||||||||
| EW5H4 | 150 | pKY65 | AP1 | ||||||||||||||||
| EW18F6 | 140 | pKY65 | AP1 | ||||||||||||||||
| EW4H7 | 180 | pKY65 | AP1 | ||||||||||||||||
| yUP11B6 | 250 | yUP11B6L | mi462 (107.48) | m453A (109.03) | |||||||||||||||
| yUP10C12 | 270 | mi462 (107.48) | |||||||||||||||||
| yUP11A8 | 290 | m252 | yUP11B6L | ||||||||||||||||
| yUP15E11 | 290 | m252 | yUP11B6L | ||||||||||||||||
| F5A21 | F15I16ab | mi462 (107.48) | F2N3T7 | T19M22ii | F2N11 | F20P5 | F19I21ab | ||||||||||||
| F20P5 | F15I16ab | mi462 (107.48) | F2N3T7Sp6 | F2N11 | F20P5 | F19I21ab | |||||||||||||
| F2N11 | T10N8 | T3P14 | F2N3Sp6 | T19M22ii | F28H22b | F2N11 | F20P5 | mi103 (108.49) | |||||||||||
| F10B24 | T3P14 | T19M22ii | F28H22b | F2N11 | mi103 (108.49) | ||||||||||||||
| CIC6D4 | 420 | nga128 (81.42) | nga280 (81.42) | ve069 | mi103 (108.49) | >1 location | |||||||||||||
| yUP6F9 | 290 | nga280 (81.42) | mi303 (81.67) | mi103 (108.49) | >1 location | ||||||||||||||
| yUP21G1 | - | nga280 (81.42) | yUP6D3R* | mi103 (108.49) | *=Unconfirmed or weak | >1 location | |||||||||||||
| yUP12G7 | 300 | mi103 (108.49) | |||||||||||||||||
| F14L14 | m252 | T3P14 | F5A18T7 | f9a19t7 | F22L14 | ||||||||||||||
| F5A18 | m252 | f5a18sp6 | F5A18T7Sp6 | f9a19t7 | F22L14 | ||||||||||||||
| F15H11 | F9K12 | f5a18sp6 | F5A18Sp6 | F22L14 | |||||||||||||||
| F22L14 | f5a18sp6 | F5A18Sp6 | F22L14 | CIC11B7 | |||||||||||||||
| F8M17 | f1206t7 | F22L14 | |||||||||||||||||
| F12O6 | F9K12 | f1206t7 | F22L14? | ||||||||||||||||
| F10G9 | F9K12 | F10M8Sp6 | F4A2T7 | f1206t7 | f26a9t7 | T17G20 | T18H11a | CIC7E8 | f10g5sp6 | f23n20sp6 | f3b19t7sp6 | ||||||||
| F4A2 | F9K12 | F10M8Sp6? | F4A2T7Sp6 | f1206t7 | f26a9t7 | T18H11ab? | CIC7E8 | f10g5sp6 | f23n20sp6 | f3b19t7sp6 | |||||||||
| F6E19 | T31G22 | F10M8Sp6 | F4A2Sp6? | f26a9t7 | PAB5 (110.42) | F25O6? | F7E12? | F14O23 | T17G20 | CIC7E8 | f3b19t7 | ||||||||
| F8M3 | T31G22 | F10M8Sp6? | f26a9t7 | PAB5 (110.42) | F25O6 | F7E12 | F14O23 | T17G20 | CIC7E8 | f3b19t7 | |||||||||
| CIC4E4 | PAB5 (110.42)* | *=Unconfirmed or weak | |||||||||||||||||
| CIC1E9 | PAB5 (110.42)* | *=Unconfirmed or weak | |||||||||||||||||
| CIC7E8 | 490 | "182" | ve105 | g13950 | PAB5 (110.42) | ||||||||||||||
| yUP15C3 | 140 | PAB5 (110.42) | |||||||||||||||||
| CIC12A5 | 540 | ve105 | g13950 | ||||||||||||||||
| CIC2G10a | 380 | g13950 | |||||||||||||||||
| CIC11B11 | 420 | ve105 | g13950 | PAB5 (110.42) | |||||||||||||||
| CIC12G10 | 560 | ve105 | |||||||||||||||||
| CIC3F2 | 550 | g8057 | ve105 | ||||||||||||||||
| yUP18E12 | 200 | g13950 | |||||||||||||||||
| CIC11B11 | 420 | g13950 | |||||||||||||||||
| CIC12A5 | 540 | g13950 | |||||||||||||||||
| CIC12G10 | 560 | g13950 | |||||||||||||||||
| yUP8G2 | 300 | g4721 | yUP12F12L | g13950 | |||||||||||||||
| yUP7F6 | 330 | g4721 | yUP12F12L | g13950 | g17565 | yUP20B1L | |||||||||||||
| yUP12F12 | 260 | yUP12F12L | yUP19H2R | nga111 (111.44) | |||||||||||||||
| yUP24G1 | 70 | yUP12F12L | g6838*** | g17565 | |||||||||||||||
| yUP16F12 | 50 | g8480 | g17565 | >1 location | |||||||||||||||
| yUP14H1 | 80 | g17565 | |||||||||||||||||
| yUP24A7 | 10 | g17565 | |||||||||||||||||
| yUP12A8 | 310 | nga111 (111.44) | g17565 | ||||||||||||||||
| yUP21A5 | - | nga111 (111.44) | |||||||||||||||||
| CIC9C4 | 580 | GER1 | g13950 | m315 (93.96) | JG4 | JJ2 | nga111 (111.44) | ve050 | ve116 | >1 location | |||||||||
| CIC12H9 | 780 | GER1 | g13950 | JG4 | JJ2 | nga111 (111.44) | ve050 | ve116 | |||||||||||
| CIC6H1 | 530 | g14226 | EIL3 | AtCTRg chr5 | JG4 | JJ2 | nga111 (111.44) | ve050 | ve116 | ||||||||||
| CIC2F9 | 400 | g14226 | EIL3 | g8057 | AtCTRg chr5 | ||||||||||||||
| yUP14G9 | 140 | EIL3 | |||||||||||||||||
| CIC9A6 | 410 | g14226 | |||||||||||||||||
| CIC2B11 | 480 | g14226 | |||||||||||||||||
| yUP6F5 | 600 | yUP19H2R | |||||||||||||||||
| yUP9A3 | 270-300 | yUP19H2R | |||||||||||||||||
| yUP19H2 | 550 | mi100 (8.76) | yUP19H2L | yUP7F4L | g5957 | g15894 | chimera | ||||||||||||
| CIC2G2 | 420 | g14226 | EIL3 | g8057 | mi425 (113.89) | ||||||||||||||
| yUP1C12 | 160 | mi425 (113.89) | |||||||||||||||||
| yUP7A10 | 260 | mi425 (113.89) | |||||||||||||||||
| yUP8E7 | 320/150 | mi425 (113.89) | |||||||||||||||||
| yUP11A10 | 260 | mi425 (113.89) | |||||||||||||||||
| yUP15G11 | 120 | mi425 (113.89) | |||||||||||||||||
| yUP20E2 | 310 | mi425 (113.89) | |||||||||||||||||
| yUP24B4 | 330 | mi425 (113.89) | |||||||||||||||||
| CIC9H1 | 500 | mi425 (113.89) | mi121-2 chr5 | ||||||||||||||||
| F2H22 | F11K1 | F2B18Sp6 | mi425 (113.89) | F9E10 | F2H22 | F11D4 | |||||||||||||
| F18H11 | CIC10C4a | F11K1 | F2B18Sp6 | mi425 (113.89) | F22K9 | F9E10 | F2H22 | CIC2D3 | T7B13 | F11D4 | |||||||||
| F4O3 | CIC10C4a | yUP3G5 | T9H3 | f9e10sp6 | mi121a | f22h11sp6 | T7B13 | ||||||||||||
| F2D13 | yUP3G5 | T9H3 | mi121a | f22h11t7sp6 | T7B13 | ||||||||||||||
| F1B16 | yUP3G5 | T9H3 | f18a11t7 | f22h11t7 | |||||||||||||||
| F16N1 | yUP3G5 | T9H3 | f18a11t7 | f22h11t7 | |||||||||||||||
| F26M20 | F2P13 | f5m4t7 | m532 (114.52) | f18a11sp6 | F8L12 | ||||||||||||||
| F2P13 | F2P13 | f5m4t7 | m532 (114.52) | f18a11sp6 | F8L12 | ||||||||||||||
| CIC6D10 | 460 | ve126 | ve131 | mi121-2 chr5 | CD3-42-2 | ||||||||||||||
| CIC2D1 | 360 | ve126 | PC(AC) | ||||||||||||||||
| CIC4F1 | 480 | ve126 | PC(AC) | g6838 | CD3-42-2 | ||||||||||||||
| CIC11F4 | 670 | ve126 | PC | CD3-42-2 | AthATPase (114.57) | ||||||||||||||
| yUP4H9 | 240 | g6838 | AthATPase (114.57) | ||||||||||||||||
| yUP4B3 | 310 | m532 (114.52) | g6838 | B2 | EW16B12L | AthATPase (114.57) | |||||||||||||
| EW16B12 | - | B2 | EW16B12L | ||||||||||||||||
| EW11G6 | - | B2 | EW16B12L | ||||||||||||||||
| yUP13C10 | 300 | m532 (114.52) | g6838 | B2 | |||||||||||||||
| EW1G5 | - | g6838 | B2 | ||||||||||||||||
| EG8D6 | 190 | m237 | m532 (114.52) | g6838 | B2 | ||||||||||||||
| yUP7C7 | 250 | yUP7C7L | m237 | m532 (114.52) | g6838 | B2 | |||||||||||||
| yUP15E6*** | 20 | g6838 | |||||||||||||||||
| EW6G11 | - | N7-24 | S3 | KG24 | |||||||||||||||
| EW4E10 | - | N7-24 | S3 | KG24 | EW6G11L | ||||||||||||||
| yUP17F5 | 150 | N7-24 | S3 | EW6G11L | |||||||||||||||
| yUP7C8 | 260 | N7-24 | yUP7C7L | EW6G11L | |||||||||||||||
| yUP3G5 | 300 | N7-24 | yUP7C7L | S3 | EW6G11L | yUP23H9L | >1 location, BAC hyb data in 2 places | ||||||||||||
| yUP7E7 | 290 | yUP7C7L | |||||||||||||||||
| EG6A3 | 125 | m237 | |||||||||||||||||
| EG9E5 | - | m237 | |||||||||||||||||
| yUP4A12 | 340 | yUP17A11R* | *=Unconfirmed or weak | >1 location | |||||||||||||||
| yUP17A11 | 345 | yUP17A11R* | m237 | ADH (114.23) | |||||||||||||||
| EG4E2 | 200 | ADH (114.23) | |||||||||||||||||
| EG9G11 | - | ADH (114.23) | |||||||||||||||||
| EG13H7 | - | ADH (114.23) | |||||||||||||||||
| yUP6A6 | 150-280 | msu31B3 | ADH (114.23) | ||||||||||||||||
| yUP6A7 | 290 | msu31B3 | ADH (114.23) | ||||||||||||||||
| yUP7D10 | 250 | msu31B3 | yUP7D10L* | ADH (114.23) | *=Unconfirmed or weak | ||||||||||||||
| yUP3B7 | 300 | yUP7D10L* | *=Unconfirmed or weak | ||||||||||||||||
| yUP11E1 | 75 | yUP7D10L* | *=Unconfirmed or weak | ||||||||||||||||
| F26N21 | F4A9T7 | T10K14 | T25H23 | F7O12Sp6 | F22K20 | F1H20 | f21h13t7sp6 | ||||||||||||
| F20A22 | F4A9T7 | T10K14 | T25H23 | F22K20 | F1H20 | f21h13t7sp6 | |||||||||||||
| F6G12 | F4A9T7? | T10K14 | T25H23 | yUP17A11 | f21h13t7sp6 | ||||||||||||||
| F2P24 | F4A9T7 | T10K14 | T25H23 | yUP17A11 | T4I3? | F1H20 | f21h13t7sp6 | ||||||||||||
| F14L6 | T10K14 | T25H23 | F7F13 | ||||||||||||||||
| F13C10 | F16N24T7 | T10K14 | T4I3? | F7F13 | |||||||||||||||
| F12F4 | F16N24Sp6 | F23L5 | F4D23 | F7F13 | T25A18 | T26P8 | T32H6 | ||||||||||||
| F6O11 | F16N24Sp6 | F23L5 | F4D23 | T4I3 | F7F13 | T25A18 | T26P8 | T32H6 | |||||||||||
| F4D23 | F19F4? | F23L5 | F4D23 | F14D21 | T25A18 | T26P8 | |||||||||||||
| F28K19 | T7D2 | F19F4 | F23L5? | F4D23 | F14D21 | F28K19 | F2C5 | T25A18 | T26P8? | CIC10C4a | |||||||||
| F19F4 | T7D2 | F19F4 | F4D23 | F14D21 | F28K19 | F2C5 | CIC10C4a | ||||||||||||
| F2C5 | F19F4 | F28K19 | F2C5 | ||||||||||||||||
| CIC10C4 | 500 | ve011 (116.10) | ve097 | g8480 | nga6 chr3 | nga112 chr3 | mi121-2 chr5 | >1 location | |||||||||||
| CIC7D2 | 410 | ve011 (116.10) | NIA1 | ||||||||||||||||
| EG7D9 | - | NIA1 | |||||||||||||||||
| F14J10 | T7D2 | F3A23 | F14J10 | T1C5 | T17C4 | T22O22 | F27J21 | CIC10C4a | |||||||||||
| F3A23 | T7D2 | F3A23 | F14J10 | T1C5 | T17C4 | F27J21 | |||||||||||||
| F2F15 | F3A23 | f2f15t7 | T17C4 | T22O22 | F12L4 | F20L11 | F27J21 | f3n1sp6 | |||||||||||
| F14E17 | F3A23 | f2f15t7 | T17C4 | T22O22 | F12L4 | F27J21 | f3n1sp6 | CIC10C4a | |||||||||||
| F18F22 | f2f15t7 | T17C4 | F27J21 | f3n1sp6 | |||||||||||||||
| F3N1 | T7D18 | f2f15t7 | F3J23 | f3n1t7sp6 | |||||||||||||||
| F5I2 | yUP8H12 | T7G11 | F3J23 | f3n1t7 | |||||||||||||||
| F3J23 | yUP8H12 | T7G11 | t22m9 | F3J23 | f3n1t7 | ||||||||||||||
| yUP2G8 | 360-390 | yUP20B1L | |||||||||||||||||
| yUP9A3 | 270-300 | yUP20B1L | |||||||||||||||||
| yUP20B1 | 330 | yUP6B8L | yUP8H12R | yUP20B1L | |||||||||||||||
| yUP20H8 | 400 | yUP8H12R | |||||||||||||||||
| yUP20B6 | 290 | yUP8H12R | |||||||||||||||||
| yUP8H12 | 300 | AXR1 | m488 (5.63) | yUP8H12L | yUP8H12R | EW2H9L | chimera | ||||||||||||
| F17H14 | yUP8H12 | F14M1T7Sp6 | F16N6 | t22m9 | F9C21 | F10O8 | f10o8t7? | ||||||||||||
| F14M1 | CIC6C10? | yUP8H12 | F14M1T7Sp6 | F16N6 | F9C21 | f10o8t7? | |||||||||||||
| F17C14 | CIC6C10? | yUP8H12 | F14M1Sp6? | F16N6 | F7B5Sp6 | F25I1Sp6 | CIC3G12 | F9C21 | F10O8 | CIC1E4 | |||||||||
| F2B13 | CIC6C10? | yUP8H12 | F14M1T7 | F16N6 | F7B5Sp6 | F25I1Sp6 | F9C21 | F10O8 | CIC1E4 | ||||||||||
| CIC11G11 | 500 | ve043 (120.51) | ve059 | ||||||||||||||||
| CIC6C10 | 465 | ve043 (120.51) | ve059 | CIC6C10R | |||||||||||||||
| CIC10A11 | 530 | m132A (121.05) | g17311 (122.14) | ve043 (120.51) | ve059 | CIC6C10R | GL2 | ||||||||||||
| CIC1E4 | 610 | m132A (121.05) | g17311 (122.14) | ve043 (120.51) | ve059 | CIC6C10R | GL2 | ||||||||||||
| EG4G5 | - | m132A (121.05) | |||||||||||||||||
| EG13H5 | - | m132A (121.05) | |||||||||||||||||
| EG1D9 | - | g17311 (122.14) | |||||||||||||||||
| EG1D10 | - | g17311 (122.14) | |||||||||||||||||
| EG20A3 | - | g17311 (122.14) | |||||||||||||||||
| yUP12E9 | 140 | g17311 (122.14)* | *=Unconfirmed or weak | ||||||||||||||||
| F28G1 | F23A5 | F11N10 | T9B14 | F25M5 | F22A2T7 | F5I6 | F9B4 | F7K1 | |||||||||||
| F7K1 | F23A5? | F11N10 | T9B14? | T25E24? | F25M5 | F22A2T7 | F9B4 | ||||||||||||
| F11N10 | m132A (121.05) | F23A5 | F11N10 | T9B14 | mi157 (121.09) | F22A2T7 | CIC1E4 | F9B4 | F7K1 | ||||||||||
| F23A5 | F23A5 | F11N10 | T9B14 | F22A2T7 | CIC1E4 | F9B4 | |||||||||||||
| yUP7B8 | 240 | mi15 (38.92)7* | mi157 (121.09) | *=Unconfirmed or weak | >1 location | ||||||||||||||
| CIC5G4 | 495 | gamma-TIP | |||||||||||||||||
| CIC12G5 | 500 | gamma-TIP | |||||||||||||||||
| CIC12G9 | 370 | g4121* | gamma-TIP | *=Unconfirmed or weak | |||||||||||||||
| CIC8G7a | <100 | g14148(MC) | |||||||||||||||||
| CIC9E12 | - | g14148(MC) |